Informaticien ou Informaticienne, préparation des données et intégration de modèles d'IA

National Research Council Canada • Saskatoon, SK

9d • CA$86,503 - CA$108,068 • Onsite

About The Position

Le CNRC est à la recherche d’un ou une informaticien ou informaticienne dans les domaines de la génomique et de l’intelligence artificielle (IA) pour faire partie de l’équipe des technologies de génomique comparative et régulatrice du Centre de recherche en développement des cultures et des ressources aquatiques (DCRA) à Saskatoon. Membre d’une équipe multidisciplinaire qui combine des technologies génomiques de pointe et l’apprentissage automatique afin de développer une compréhension prédictive de la biologie végétale, la personne retenue appuiera les initiatives du CNRC visant l’intégration de la génomique et de l’IA axées sur les données. Elle participera aux aspects computationnels de la génération de données, de la normalisation, du contrôle de la qualité, du traitement des métadonnées et des données bio‑informatiques en formats prêts pour la modélisation, ainsi qu’à l’entraînement, à la validation et au déploiement de modèles. L’un de ses principaux objectifs initiaux sera de préparer les données pour la modélisation en encapsulant et en normalisant les principaux pipelines de traitement des données pour DCRA. La personne retenue devra partager nos valeurs fondamentales d’intégrité, d’excellence, de respect et de créativité.

Requirements

• Baccalauréat en informatique, en bio-informatique, en biologie computationnelle ou dans une discipline connexe.
• Expérience en analyse bioinformatique dans un environnement informatique Linux, à l’aide de langages de programmation tels que Python, R ou des scripts Bash.
• Expérience dans la conception, la mise en œuvre et la maintenance de flux de travail reproductibles à l’aide de systèmes de gestion de flux de travail (Snakemake, Nextflow, etc.).
• Expérience récente avec les formats de données génomiques (FASTQ, BAM, VCF, GTF, CRAM, etc.) et les outils d’analyse en ligne de commande (p. ex., STAR, GATK, DESeq2, Orthofinder, Genespace, samtools, HifiASM, Verkko).
• Expérience récente dans le déploiement de flux de travail sur des planificateurs de tâches (p. ex., Slurm) et dans l’utilisation d’outils de conteneurisation (p. ex., Docker, Singularity).
• Solides connaissances des principes de la bio-informatique, des structures de données génomiques et de l’automatisation des flux de travail.
• Solides compétences en conception et en mise en œuvre de pipelines de traitement de données reproductibles à l’aide d’outils de gestion des flux de travail et de la conteneurisation.
• Capacité à gérer et à intégrer des métadonnées conformément aux principes FAIR.
• Solides connaissances des techniques de préparation des données pour l’apprentissage automatique et la modélisation prédictive.
• Cote de fiabilité

Nice To Haves

• Un diplôme d’un institut technique en informatique ou dans un domaine connexe, ou une combinaison équivalente de formation et d’expérience professionnelle directe, peut être pris en considération.
• Expérience de l’application des principes FAIR, des normes de métadonnées et des méthodes d’intégration de bases de données, un atout.
• Connaissance des cadres d’IA et d’apprentissage automatique (TensorFlow, PyTorch, scikit learn, etc.) et de la préparation des données pour la modélisation prédictive, un atout.
• Expérience de travail dans un environnement collaboratif et multidisciplinaire, un atout.

Responsibilities

• Participer aux aspects computationnels de la génération de données, de la normalisation, du contrôle de la qualité, du traitement des métadonnées et des données bio‑informatiques en formats prêts pour la modélisation.
• Entraîner, valider et déployer des modèles d'IA.
• Préparer les données pour la modélisation en encapsulant et en normalisant les principaux pipelines de traitement des données pour DCRA.
• Évaluer et dépanner des outils et des flux de travail bioinformatiques.

Benefits

• Régime de retraite solide
• Régime de soins de santé complets
• Régime de soins dentaires complets
• Assurance-vie
• Assurance-invalidité
• Fermeture des bureaux à la fin du mois de décembre
• Soutiens supplémentaires pour améliorer votre bien-être durant et après votre carrière.

What This Job Offers

• Job Type: Full-time
• Career Level: Mid Level